就这样贝勒们均主动请求退出并坐，立即就得到了后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极，的允准。
明崇祯五年公元1632年正月初1日元旦，在朝贺中，后金天聪汗接受了后金礼部参政：李伯龙，的建议，废除了与三大贝勒俱南面坐、共理朝政的旧制，改为自己南面独坐，以突出汗位独尊地位。
正月初2日，明叛将：孔有德、耿仲明、李九成，又从莱州府潍县、昌邑县、平度州，逐渐逼近登州府，明登莱总兵：张可大，连忙请示出击抵抗。
随即明山东总镇巡按：王道纯、明山东总督：刘宇烈，则主张围剿便领兵列阵准备迎敌。
而明登莱巡抚：孙元化、明山东总镇巡抚：余大成、明武英殿大学士：周延儒、明兵部尚书：熊明遇，也主张安抚，认为眼下叛军造反不可武力镇压。
正月初3日，就在官员们商议剿抚之时，叛将：耿仲明，已经率军入登州府莱阳县、栖霞县，并且逼近登州府首府蓬莱县、登州卫，一带地区。
还找到机会，私下联系明东江镇坐营右参将：张焘，而这张参将部下又与明叛将：孔有德，曾是好友，其麾下将领军士都是熟人，因此张参将部下的兵卒们，也随即投入到明叛将：孔有德，行列当中。
在叛军们攻打登州卫城门时，明登州卫镇抚使：陈光福、明福山中前守御千户：高志祥、明登州卫百户：苏有功，等部将还故意打开城门响应明叛将：孔有德，做到里应外合。
一起夺取了登州卫城池，城内守军们7千人（登州卫明军6千人、援军1千人）全被明叛将：孔有德，给收编还获得马三千匹、饷银十万两、红夷大炮二十门、西洋炮三百门。
明叛将：孔有德，还以此募兵，叛军吸纳了诸多乌合之众，一度扩张至十万人规模。
在叛军们入城之后，立即抓捕了自尽未遂的明登莱巡抚：孙元化，以及明山东提刑按察使司佥事兼辽海监军道：王徵、明登州府知府：吴维城、明登州府同知：贾名杰、明蓬莱县知县：秦世英，等人。
叛军们又在登州卫城内抓捕到了明东江总镇总兵：黄龙，的母亲、妻子及幼子，明叛将：孔有德、耿仲明，还拿黄母头上的金簪，并派人前去东江镇招降黄总镇总兵。
同时明宁海州总兵：吴安邦，率兵前来抵抗却已兵败收场！
正月初4日，明登莱巡抚：张可大，因抵抗不住叛军最后弹尽粮绝，逃到杨家店巡检司自知已无退路，便解下佩印交付部下，还写信给母亲，并杀其妾：陈氏，自缢而死。
同时叛军将领们面见曾经的上司，明登莱巡抚：孙元化，这位上司对孔有德等叛将们有恩，也不想他们继续走上叛逆之路，便晓以利害深明大义，希望叛将他们能够早些回心转意，请求朝廷的招安。
本来他们也没犯什么大事，而且眼下辽东都指挥使司也需要军事将才，因此孙巡抚亲自写信上报朝廷诏安。
正月20日，在孙巡抚联系官员们提议诏安之时，叛军们也来到了东江镇境内，面对叛军使者送来的母亲金簪，让明东江总镇总兵泪如雨下，却只是对着金簪跪拜，坚绝不降。
正月27日，与明叛将：孔有德，交好的明金州守御千户所左参将：陈有时、明广鹿岛左参将：毛承禄（前任明东江总镇总兵：毛文龙，族子，非亲生子）也一起兵响应，该部一举发展为七八千人的大军。
还一度割据了半个皮岛，企图与山东承宣布政使司叛军们南北呼应。
吓得明东江总镇总兵：黄龙，急忙派遣明东江镇水营游击将军：尚可喜、明大长山岛左参将：金声桓，等将领安抚平定诸岛。
叛将：陈有时、毛承禄，等招架不住东江镇与皮岛部附近水师明军夹击，不得已南下败走山东承宣布政使司登州府，企图与叛军主力会合，仅留下明金州守御千户：高成友，驻守以阻断关宁军、天津三卫，两镇来的援军，为叛军们赢取时间。
随即明东江总镇总兵就调动明麻洋岛游击将军：李维鸾，协同明东江镇水营游击将军：尚可喜，等将领一举把金州守御千户所给击破。
并立即移军驻扎在金州守御千户所，让援军们得以通畅。
紧接着明叛将：孔有德、耿仲明，又转而想诱降黄总镇总兵十二岁的幼子：黄大喜，想通过小孩来胁迫黄总镇总兵投降。
但黄大喜却很有气节，年轻虽小却敢破口大骂孔、耿二人，结果下场很惨，当即被杀，人头落地，黄母、黄夫人也随之被害。
2月初1日，明叛将：孔有德，采用叛将：耿仲明，之计尽放明登莱巡抚：孙元化、明山东提刑按察使司兼辽海监军道：王徵，等人回朝提诏安之事。
然而此事一出明天津三卫巡抚：郑宗周，变让明天津卫总兵：孙应龙，前去劝降，因为他与叛将：耿仲明，曾经是好友，可以写书信劝降。
却不曾想耿仲明将计就计，随便找了个人头送了过去，说他已经斩了明叛将：孔有德，还让孙总兵迅速来受降。
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